Pszichiáter édesanyja a munkája során felhalmozódott stressz következtében 1971-ben idegösszeomlást kapott, majd ezt követően hosszú évek teltek el, míg teljesen felépült. Miután édesanyja meggyógyult, bankár apjánál rosszindulatú agydaganatot diagnosztizáltak. A tumort később megműtötték, de a beavatkozás nem járt sikerrel, ezért a férfi részben megbénult (1979). Ezután apját egy ideig kórházban tartották, de később otthon ápolták anyjával.

Tinédzser korában az iskola mellett szabadidejében verseket irt. Ennek eredményeképpen 15 évesen (1981-ben) megnyert egy irodalmi versenyt. A dijjal járó pénzösszeget arra költötte, hogy hirdetést adott fel egy magazinban, melyben fiatal tehetségekről írtak. Nem sokkal ezután, egy megyei ügynök segítségével megindult bámulatos karrierje.
A fiatal lány gyakran vett részt ünnepélyes és előkelő rendezvényeken, bálokon. Mindenkit elbűvölt visszafogott, de mégis felsőbbrendűséget sugárzó fellépése miatt.

1994-ben ismerkedett meg Kenneth Branagh-val, akivel együtt játszottak Mary Shelley klasszikus regénynek, a Frankensteinnek a feldolgozásában. Nem sokkal ezután a szinész elvált feleségétől - Emma Tomphsontól - és Helenával közös házba költöztek. Öt évvel később kapcsolatuk ugyanolyan gyorsan és viharosan ért véget, ahogy kezdődött. A szakítás oka, az volt, hogy Helena egy rövid románcba bonyolódott Steve Martinnal.

Röviddel a Majmok bolygója befejezése után elkezdett találkozgatni Tim Burton rendezővel. A kezdődő szerelemről a színésznő azt mondta "Fontos volt számomra, hogy megszerezzem őt, mert mi teljesen összeillünk. Mindkettőnknek nehezére esik felnőni, és magunkba hordozunk egy kis darabot Peter Pan-ból." Nem sokkal ezután 2001. októberében összeházasodtak. 2003. október 6-án megszületett első közös gyermekük Billy Ray. 2007-ben megszületett kislányuk Nell.

2008 decemberében Helena felszólalt az MTV-n a családon belüli erőszak ellen.

2009 elején Bonham Carter több sztárral együtt (Ewan McGregor, Kate Winslet, Liam Neeson, Helen Mirren stb.) kiárusítanak egy kártyát saját csóklenyomatukkal és az aláírásukkal a Newcastle híres Fenwick boltjában. A befolyt összeget jótékony célokra fordítják.

2009 - Terminátor - A megváltás (Terminator Salvation)

2009 - Harry Potter és a Félvér herceg (Harry Potter and the Half-Blood Prince)

2007 - Sweeney Todd

2007 - Harry Potter és a Főnix Rendje (Harry Potter and the Order of the Phoenix)

2006 - Conversation With Other Women

2005 - Wallace és Gromit és az Elvetemült Veteménylény (Wallace & Gromit in The Curse of the Were-Rabbit)
Lady Campanula Tottington (szinkronhang)

2005 - Tim Burton: A halott menyasszony (Corpse Bride)
Corpse Bride (szinkronhang)

2005 - Charlie és a csokigyár (Charlie and the Chocolate Factory)

2003 - VIII. Henrik (Henry VIII)

2003 - Nagy hal (Big Fish)

2002 - Élőben Bagdadból (Live From Baghdad)

2002 - Heart of Me

2002 - Míg hangod nem ébreszt (Till Human Voices Wakes Us)

2001 - Novocain - A férfi, aki otthagyta a fogát (Novocaine)

2001 - A majmok bolygója (Planet of the Apes)

1999 - Harcosok klubja (Fight Club)

1998 - Merlin

1998 - A repülés elmélete (The Theory of Flight)

1998 - Édes a bosszú (The Revengers' Comedies)

1997 - A galamb szárnyai (The Wings of the Dove)

1996 - Vízkereszt (Twelfth Night)

1995 - Hatalmas Aphrodité (Mighty Aphrodite)

1994 - Frankenstein

1993 - Fatal Deception: Mrs. Lee Harvey Oswald

1992 - Szellem a házban (Howards End)

1991 - Ahol angyal se jár (Where Angels Fear to Tread)

1990 - Hamlet

1989 - Keresem az utam (Getting It Right)

1987 - Kockán nyert szerelem (A Hazard of Hearts)

1985 - Lady Jane

1985 - Szoba kilátással (A Room With a View)